Prix de vulgarisation scientifique pour Marion Leménager

11 mai 2023 par Simon

Dans le cadre du dernier congrès de l'Acfas, Marion Leménager s’est vue décerner un prix coup de coeur / coup de pouce du concours de vulgarisation de l’Acfas. Marion a présenté une bande dessinée décrivant ses travaux sur l’évolution des fleurs en 3D qui s’est démarquée pour son originalité. La BD intitulée Les fleurs pas du tout plates peut être consultée sur le site de l’Acfas.

Étudier les fleurs en 3D

1 décembre 2022 par Simon

Marion Leménager vient de publier un protocole permettant de reconstruire des modèles de fleurs en 3 dimensions à l'aide de la photogrammétrie. Cette approche est plus abordable et simple d'utilisation que les méthodes conventionnelles au laser. Elle montre dans l'article comment la méthode peut être utilisée pour étudier l'évolution des fleurs. Le protocole est accessible librement et tout le monde peut contribuer à l'améliorer.

Voici un modèle 3D de Rhytidophyllum vernicosum construit avec cette méthode:

L'héliotropisme chez le Trille blanc augment le succès reproducteur

29 septembre 2022 par Simon

Une étude menée par Maryane Gradito décrit pour la première fois l'héliotropisme chez le Trille blanc. L'héliotropisme, c'est le processus par lequel des organes (les fleurs dans le cas présent) suivent le soleil. Nous avons aussi démontré que l'héliotropisme chez le Trille blanc permettait aux plantes d'avoir un avantage reproductif en augmentant la proportion d'ovules fécondés. L'article est disponible en libre accès. Et voici une vidéo montrant le mouvement des fleurs au cours d'une journée:

Les travaux de Gonzalo Bilbao sur la page couverture de l'American Journal of Botany

29 septembre 2021 par Simon

Les travaux de Gonzalo Bilbao sur l'évolution des formes des pétales du genre Erythrina ont fait la couverture du numéro de septembre de l'American Journal of Botany. Gonzalo a montré que les formes 2D des pétalespouvaient prédire les modes de pollinisation chez le genre Erythrina (Fabaceae). Fait intéressant à souligner, même si beaucoup d'attention a été porté à la forme de l'étandard pour prédire les modes de pollinisations par le passé, les résultats montrent quand la forme des ailes mait surtout la carène contiennent aussi beaucoup d'information permettant d'améliorer les prédictions. Vous aurez plus de détails en lisant l'article.

Production de fleurs fermées: Darwin avait raison

4 février 2020 par Simon

Certaines plantes produisent deux types de fleurs: des fleurs normales et des petites fleurs qui ne s'ouvrent jamais, mais qui peuvent se reproduire en absence de pollinsateurs. Ces dernières sont des fleurs cléistogames et le phénomène s'appelle la cléistogamie. Cette capacité étonnante de pouvoir produire deux types de fleurs n'est pas fréquente, mais elle est néanmoins répandue puisqu'elle peut être observé chez plus de 40 familles de plantes. C'est un bel exemple d'évolution convergente. Darwin a émit l'hypothèse que la cléistogamie évoluait plus fréquemment chez les espèces qui ont des fleurs à symétrie bilatérale (un seul plan de symétrie, comme les violettes ou les orchidées). C'est parce que la cléistogamie permet la reproduction en l'absence des pollinisateurs et que les fleurs à symétrie bilatérale sont typiquement pollinisées par moins d'espèces de pollinisateurs que les fleurs à symétrie radiale (plusieurs plans de symétrie, comme les roses ou les marguerites) et ont donc plus de chance de ne pas se reproduire si certains pollinisateurs se faisaient rares. À l'aide d'un jeu de données de plus de 2500 espèces, Simon Joly et Daniel Schoen (McGill) on confirmé l'hypothèse de Darwin. L'étude détaillée peut être lu dans Current Biology.

Félicitation Dr. Julie Faure

21 décembre 2020 par Simon

Félicitation à Julie Faure qui a soutenu sa thèse avec brio le 16 décembre 2020. Sa thèse est intitulée "Adaptation florale aux pollinisateurs : étude des Gesneriaceae antillaises et de l’Impatiente du Cap". Bravo Julie et bonne chance pour la suite!

Comment se reproduire suite à un ouragan?

18 novembre 2020 par Simon

Julie Faure vient de publier le premier chapitre de sa thèse qui rapporte les données de pollinisation pour Rhytidophyllum bicolor, une espèce endémique d'Haïti. Ce qui est intéressant avec cette étude, c'est qu'elle a eu lieu 15 mois après l'ouragan Matthew qui a dévasté Haïti en 2016. Rhytidophyllum bicolor, qui et généraliste pour la pollinisation, continue d'être pollinisé par les chauves-souris et les abeilles même si les colibris ont été pratiquement éradiqués de la région par l'ouragan.

Librairie multi-plateforme pour l'analyse de la variation intra- et interspécifique

3 novembre 2020 par Simon

Dans une récente étude réalisée en collaboration avec des collègues de Suisse, de Nouvelle-Zélande et de Suède, nous présentons une nouvelle librairie multi-plateforme (R, BEAST2) qui implémente le modèle JIVE permettant de modéliser l'évolution des traits et de leurs variances.

Étude sur la génétique des arbres et des changements climatiques

7 mai 2019 par Simon

Dand une nouvelle étude faite en collaboration avec Elizabeth Wolkovich (UBC), nous avons montré que de prendre en compte les relations phylogénétiques entre les espèces ainsi que les similarités génétiques au sein des espèces permettait d'obtenir des résultats plus précis dans les études écologiques effectuées simultanément sur plusieurs espèces. En appliquant cette approche à une étude sur l'effet des changements climatiques sur 10 espèces d'arbres et arbustres, nous avons montré que de considérer la génétique des arbres permettait de mieux prédire la réponse de ces derniers aux changements climatiques.

Bienvenue à Maryane Gradito

6 mai 2019 par Simon

Bienvenue à Maryane Gradito, une stagiaire NSERC BRPC pour l'été dans le labo qui va travailler sur la reproduction du Trille blanc.

Article sur l'holobionte du saule

22 mars 2018 par Simon

Dans ce récent article, nous présentons des résultats de métatranscriptomique (étude de l'expression des gènes de plusieurs organismes) qui montrent que les saules qui ont grandi dans des sols contaminés ne montrent pas seulement une expression différentielle des gènes de la plante, mais aussi des changements au niveau des communautés fongiques et bactériennes associées aux racines de la plante. Cela montre qu'il est important de considérer les réactions de la plante et de ses organismes associés pour comprendre la réaction des organismes à leur environnement. C'est le concept d'holobionte.

Nouvelle subvention pour travailler sur l'adaptation du blé à la sécheresse

5 février 2017 par Simon

Nous sommes content de pouvoir annoncer que nous avons obtenu une subvention CSRNG Stratégique pour étudier l'adaptation du blé en condition de sécheresse. Le projet est mené par Étienne Yergeau de l'Institut Armand-Frappier (INRS) et est fait en collaboration avec la compagnie Kopert, Philippe Contant de l'INRS et Marc St-Arnaud du Jardin botanique de Montréal. Le projet évaluera principalement le potentiel du microbiote associé au blé, mais aussi de l'épigénétique, dans l'adaptation à la sécheresse.

Félicitation à Marie Florence Sandrine NGO NGWE

15 décembre 2016 par Simon

Nous tenons à féliciter Sandrine Ngo Ngwe, qui à soutenu sa thèse de doctorat avec succès à l'été 2016, pour sa nomination comme chef de l'Herbier National du Cameroun. Bravo pour ce bel accomplissement!

Félicitation au Dr Alexandre!

5 novembre 2016 par Simon

Félicitation à Hermine Alexandre qui vient tout juste de soutenir sa thèse de doctorat avec succès! Hermine commence un stage post-doctoral à Bordeaux, France, en janvier 2017. Hermine, ce fût un énorme plaisir de te cotoyer pendant plus de 4 années au laboratoire! Bonne chance dans tes projets.

Quelles plantes deviendront naturalisées ou envahissantes?

27 octobre 2016 par Simon

Simon Joly a contriué à une étude qui vient d'être publiée dans la revue Ecology and Evolution et qui propose des modèles statistiques afin de prédire quelles plantes deviendront naturalisées ou envahissantes au Québec. Les caractéristiques des plantes ont été étudiées, mais aussi la pression de propagules avec l'aide des données de vieux catalogues, de publications scientifiques et de spécimens d'herbier. Les résultats montrent que la rusticité est importante pour qu'une plante devienne naturalisée, mais que pour devenir envahissante, les plantes doivent aussi avoir de bonnes qualités de dispersion.

Félicitation à Gonzalo!

15 juillet 2016 par Simon

Nous offrons toutes nos félicitations à Gonzalo qui a obtenu la prestigieuse bourse espagnole Caixa. Bravo!

Nouveau package R

1 février 2016 par Simon

Publication du nouveau package R pofadinr qui implémente les distances genpofad et matchstates, qui ont été décrites récemment et qui sont très efficaces pour estimer les distances génétiques entre individus. Elles sont particulièrement utiles pour des données génomiques (SNPs) et elles peuvent être utilisées avec des hybrides et des polyploides.

Bienvenue à Julie Faure

15 janvier 2016 par Simon

Le laboratoire Joly souhaite la bienvenue à Julie Faure qui entreprend un doctorat. Elle étudiera la pollinisation des Gesneriaceae Antillaises et leur impact sur l'évolution du groupe.

Diversité et évolution des ignames du Cameroun

5 janvier 2016 par Simon

Sandrine Ngo Ngwe vient de publier un article qui discute de la diversité et de l'évolution des ignames (Dioscorea ssp.) du Cameroun. Elle montre dans son article que les espèces sauvages ont une structure génétique plus importante que les espèces cultivées, potentiellement à cause des pratiques agricoles. De plus, elle a montré que la plupart des espèces ne sont pas monophylétiques.

Tolérance croisée chez les saules révélée par méta-transcriptomique

16 octobre 2015 par Simon

Cet article issu du projet GenoRem vient tout juste de paraître dans la revue BMC Plant Biology. Plusieurs membres du laboratoire ont collaboré à sa réalisation, notamment Emmanuel Gonzalez, Nicholas Brereton et Julie Marleau. L'article rapporte des travaux de métatranscriptomique (expression des gènes) de saule dans un contexte de phytorémédiation. Les résultats montrent que plusieurs gènes de saule sont différentiellement exprimés entre les traitement contaminés et non-contaminés. Mais le plus intéressant est que des gènes de plusieurs autres organismes ont aussi été isolés des tissus végétaux et sont différentiellement exprimés. C'est le cas de gènes d'araignées rouges (des acariens), qui ont infesté préférentiellement les arbres en milieu non-contaminé. Nous proposons que cela est dû à un mécanisme de tolérance croisée causé par la contamination. Cette analyse d'expression de gènes inter-règnes a été rendue possible grâce au développement d'une nouvelle approche bioinformatique qui est décrite dans l'article.

Architecture génétique des transitions de mode de pollinisation chez Rhytidophyllum

19 juin 2015 par Simon

Cet article d'Hermine Alexandre publié dans PeerJ décrit les bases génétiques impliquées dans un changement de syndrome de pollinisation généraliste vers un syndrome de pollinisation spécialiste chez Rhytidophyllum. Une analyse par QTL a permis de montrer que les changements de couleurs étaient causé par un seul gène alors que les changements de forme florale sont causés par quelques gènes ayant chacun un effet modéré. Ces résultats montrent que des changement morphologiques importants peuvent être causés par un petit nombre de gènes.

Simon Joly aux Années Lumière

27 mai 2015 par Simon

Simon Joly était de passage à l'émission Les Années Lumière pour parler de la perception de la musique par les plantes.

Laurent De Vriendt vient de faire le dépot final de son mémoire

17 avril 2015 par Simon

Bravo à Laurent de Vriendt qui a reçu son diplôme de maîtrise de l'Université Laval! Laurent a fait une très belle contribution sur l'impact the l'isolation sur la morphologie et le fitness d'une orchidée emblématique des tourbières québécoises, la Platanthère à gorge frangée.

La corrélation entre les diversités phylogénétique et fonctionnelles sur une échèle évolutive

29 mars 2015 par Simon

Ce nouvel article co-écrit avec Alain Paquette et Christian Messier étudie le lien entre les diversités phylogénétique et fonctionnelle à différentes distances évolutives.

Bienvenu Gonzalo Bilbao

24 mars 2015 par Simon

Nous somme très heureux d'accueillir Gonzalo Bilbao, co-dirigé avec Anne Bruneau, qui va étudier l'évolution des syndromes de pollinisation chez Erythrina (Fabaceae).

Nouvelles recrues

18 mars 2015 par Simon

Le laboratoire Joly est heureux d'accueillir Louna Fronteau et Julie Faure qui viennent faire leur stage de Master II dans notre laboratoire. Louna travaillera sur les bases génétiques de la perte de la couleur rouge chez Rhytidophyllum et Julie travaillera sur l'importance des intéractions plantes-pollinisateurs sur la distribution des plantes de Gesneria et Rhytidophyllum.

Nouvelles méthodes de distance basées sur les SNPs

9 juillet 2014 par Simon

Cet article publié en preprint décrit de nouvelles méthodes permettant d'estimer des distances entre individus à partir de SNPs. Elles sont particulièrement utiles en présence de variation allélique, de recombinaison et de polyploïdie. Ils sont disponibles dans le logiciel POFAD.

Voyage de récolte à Haïti

2 juin 2014 par Simon

Simon Joly et François Lambert sont de retour d'Haïti où ils ont collecté plusieurs espèces de Gesneriaceae, dont Gesneria viridiflora qui a été très peu récoltée.

Article sur l'évolution par saut de niche publié

15 décembre 2013 par Simon

Cet article décrit une approche pour tester une radiation adaptative dans un groupe en comparant la disparité environnementale à travers le temps avec ce que l'on attend d'un modèle neutre et d'un modèle d'évolution par saut de niches. Le test est appliqué sur le genre Pachycladon en Nouvelle-Zélande qui s'est diversifié depuis 1 million d'années.