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Club de lecture


Hiver 2021

Date Lieu Heure Présentateur Article ou sujet Doc
20 janv Zoom! 14h00 Andrew Blakney Présentation de projet
27 janv Zoom! 14h00 Charlotte Hagelstam Renshaw Lehtonen, S. et al. 2017. Environmentally driven extinction and opportunistic origination explain fern diversification patterns. Scientific Reports 7:4831.
3 fév Zoom! 14h00 Simon Joly Bolnick, D. I. et al. 2018. (Non)Parallel Evolution. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics 49:303–330.
10 fév Zoom! 14h00 Marion Leménager
17 fév Zoom! 14h00 Julie Faure Irfan M. et al. 2021. On the indirect environmental outcomes of COVID-19: short-term revival with futuristic long-term implications. International Journal of Environmental Health Research
24 fév Zoom! 14h00 Florence Blanchard de Tombeur, F. et al. 2020. Plants sustain the terrestrial silicon cycle during ecosystem retrogression. Science 369:1245–1248.
3 mars Zoom! 14h00 Relâche
10 mars Zoom! 14h00 Rosalie Beauchamp-Rioux Fraser, H. et al. 2018. Questionable research practices in ecology and evolution. PLOS ONE 13:e0200303.
17 mars Zoom! 14h00 Étienne Lacroix-Carignan Présentation de projet
24 mars Zoom! 14h00 Anne Bruneau Esfeld et al. 2018. Pseudogenization and Resurrection of a Speciation Gene. Current Biology. 28:3776-3786
31 mars Zoom! 14h00
7 avril Zoom! 14h00 Johanna Jantzen
14 avril Zoom! 14h00 Étienne Léveillé-Bourret
21 avril Zoom! 14h00 Carolina Vergolino
21 avril Zoom! 14h00 Jérôme Burkiewicz

Automne 2020

Date Lieu Heure Présentateur Article ou sujet Doc
30 sept Centre, B.114 12h00 Andrew Blakney
7 oct Centre, B.114 12h00 Julie Faure
14 oct Centre, B.114 12h00 --
21 oct Centre, B.114 12h00 semaine de relâche
28 oct Centre, B.114 12h00 Florence Blanchard
4 nov Centre, B.114 12h00 Simon Joly
11 nov Centre, B.114 12h00 Jérôme Burkiewicz
18 nov Centre, B.114 12h00 à déterminer
25 nov Centre, B.114 12h00 Marion Leménager
2 dec Centre, B.114 12h00 Simon Morvan
9 dec Centre, B.114 12h00 à déterminer

Hiver 2020

Date Lieu Heure Présentateur Article ou sujet Doc
Jan 29 Centre, B.114 12h00 Étienne Laliberté Apprentissage profond en écologie
Fev 5 Centre, B.114 12h00 Simon Morvan
Fev 12 Centre, B.114 12h00 Warren Cardinale-McTeague
Fev 19 Centre, B.114 12h00 Julie Faure
Fev 26 Centre, B.114 12h00 Valérie Poulin
Mars 11 Centre, B.114 12h00 Pratiques symposium
Mars 18 Centre, B.114 12h00 Anne Bruneau
Mars 25 Centre, B.114 12h00 Andrew Blakney
Avril 1 Centre, B.114 12h00 Simon Joly

Automne 2019 - Articles classiques

Date Lieu Heure Présentateur Article Doc
11 septembre Centre, B.114 12h00 Julie Faure Lecture d'un manuscrit en préparation
18 septembre Centre, B.114 12h00 Anne Bruneau Joly-Lopez Z et al. 2016. Developing maps of fitness consequences for plant genomes. Current Opinion in Plant Biology 2016, 30:101–107.
25 septembre Centre, B.114 12h00 Gonzalo Bilbao Lecture d'un manuscrit en préparation
2 octobre Centre, B.114 12h00 Simon Joly Hutchinson. 1959. Homage to Santa Rosalia or why are there so many kinds of animals? The American Naturalist 93:145-159.
9 octobre Centre, B.114 12h00 Marion Leménager Gould and Lewontin. 1979. The spandrels of San Marco and the Panglossian paradigm: a critique of the adaptationist programme. Proc R Soc B4
16 octobre Centre, B.114 12h00 Andrew Blakney Watson & Crick. 1953. A structure for deoxyribose nucleic acid. Nature.
Sanger et al. 1977 DNA sequencing with chain-terminating inhibitors. PNAS.
23 octobre Centre, B.114 12h00 Simon Morvan Hardin, G. 1968. The tragedy of the commons. Science, 162(3859), 1243-1248.
30 octobre Centre, B.114 12h00 Warren Cardinal-McTeague Darwin & Wallace 1858. On the tendency for species to form varieties; and on the perpetuation of varieties and species by natural means of selection. *This MS. work was never intended for publication, and therefore was not written with care.—C. D. 1858
6 novembre Centre, B.114 12h00 Florence Blanchard Pratique de présentation Orale pour le colloque annuel de CABO
13 novembre Centre, B.114 12h00 Julie Faure Ehrlich, P. and P. H. Raven. (1964) Butterflies and plants: a study in coevolution. Evolution 18: 586-608
20 novembre Centre, B.114 12h00 Shan Kothari Throwing shade: Physiological responses to light explain competition and facilitation in a tree diversity experiment (Invited presentation)
27 novembre Centre, B.114 12h00 à déterminer
4 décembre Centre, B.114 12h00 Anne Bruneau
11 décembre Centre, B.114 12h00 Pratiques colloque CSBQ
18 décembre Centre, B.114 12h00 à déterminer

Hiver 2019

Date Lieu Heure Présentateur Article Doc
16 janvier Centre, B.114 12h00 Andrew Blackney South et al. 2019. Synthetic glycolate metabolism pathways stimulate crop growth and productivity in the field. Science. 363(6422): xx-xx.
23 janvier Centre, B.114 12h00 Warren Cardinal-McTeague Morales‐Briones et al. 2018. Phylogenomic analyses reveal a deep history of hybridization and polyploidy in the Neotropical genus Lachemilla (Rosaceae). New Phytologist 218:1668–1684.
30 janvier Centre, B.114 12h00 Tammy Elliott Linder et al. 2018. Global grass (Poaceae) success underpinned by traits facilitating colonization, persistence and habitat transformation.
6 février Centre, B.114 12h00 Simon Joly Smith, S. A., and J. W. Brown. 2018. Constructing a broadly inclusive seed plant phylogeny. American Journal of Botany 105:302–314.
13 février Centre, B.114 12h00
20 février Centre, B.114 12h00 Sébastien Renaut Jousselin, E. et al. 2016. Assessment of a 16S rRNA amplicon Illumina sequencing procedure for studying the microbiome of a symbiont-rich aphid genus. Molecular Ecology Resources 16:628–640.
27 février Centre, B.114 12h00
6 mars Centre, B.114 12h00 Relâche -- --
13 mars Centre, B.114 12h00 Sébastien Renaut Barrett et al. 2019. Linking a mutation to survival in wild mice. Science 363:499–504.
20 mars Centre, B.114 12h00 Rosalie Beauchamp-Rioux McNickle & Dybzinski. 2013. Game theory and plant ecology. Ecology Letters, 16(4), 545-555.
27 mars Centre, B.114 12h00 Anne Bruneau Flowers et al. 2019. Cross-species hybridization and the origin of North African date palms. PNAS 116:1651–1658.
3 avril Centre, B.114 12h00 Simon Morvan
10 avril Centre, B.114 12h00 Valérie Poulin
17 avril Centre, B.114 12h00 Rosalie Beauchamp-Rioux
24 avril Centre, B.114 12h00 Julie Faure
1 mai Centre, B.114 12h00 Andrew Blackney

Automne 2018

Date Lieu Heure Présentateur Article Doc
5 septembre Centre, B.114 12h00 Fabien Cichonski L’influence des champignons ectomycorhiziens et arbusculaires sur la décomposition de la matière organique du sol en forêt tempérée
12 septembre Centre, B.114 12h00 Simon Joly Murray et al. 2017. Natural selection shaped the rise and fall of passenger pigeon genomic diversity. Science 358:951–954.
19 septembre Centre, B.114 12h00 Andrew Blackney Wang et al. 2018. A single transcription factor promotes both yield and immunity in rice. 361: 1026-1028.
26 septembre Centre, B.114 12h00 Sébastien Renaut Mehta et al. 2018. Stability of the human faecal microbiome in a cohort of adult men. Nature Microbiology 3:347–355.
3 octobre Centre, B.114 12h00 Gonzalo Bilbao Egan et al. 2018. Crop domestication alters floral reward chemistry with potential consequences for pollinator health. Front. Plant Sci. 9.
10 octobre Centre, B.114 12h00 Julie Faure Valenta et al. 2018. The evolution of fruit colour: phylogeny, abiotic factors and the role of mutualists. Scientific Reports 8:14302.
17 octobre Centre, B.114 12h00 Anne Bruneau Antonelli et al. 2018. Amazonia is the primary source of Neotropical biodiversity. PNAS 201713819.
24 octobre Centre, B.114 12h00 Etienne Laliberté Schweiger et al. 2018. Plant spectral diversity integrates functional and phylogenetic components of biodiversity and predicts ecosystem function. Nature Ecology & Evolution 2:976–982.
31 octobre Centre, B.114 12h00 --- ---
7 novembre Centre, B.114 12h00 Alizée Girard Présentation de projet
14 novembre Centre, B.114 12h00 Zachary Bélisle Mori et al. 2018. Beta-Diversity, Community Assembly, and Ecosystem Functioning. TREE. 33:549-564.
21 novembre Centre, B.114 12h00 Daniel Schoen Lahti et al. 2009. Relaxed selection in the wild. TREE. 24:487-496.
28 novembre Centre, B.114 12h00 Simon Morvan à déterminer
5 décembre Centre, B.114 12h00 Alexis Carteron à déterminer
12 décembre Centre, B.114 12h00 (pas de club de lecture) --
19 décembre Centre, B.114 12h00 Xavier Guilbeault-Mayers à déterminer

Automne 2017

Date Lieu Heure Présentateur Article Doc
20 septembre, 2017 Centre, B.114 12h00 Élyse-Ann Faubert Cardillo M. et al. 2017. The phylogeny and biogeography of Hakea (Proteaceae) reveals the role of biome shifts in a continental plant radiation. Evolution. 71:1928–1943.
27 septembre, 2017 Centre, B.114 12h00 Gonzalo Bilbao Chartier M. et al. 2017. How (much) do flowers vary? Unbalanced disparity among flower functional modules and a mosaic pattern of morphospace occupation in the order Ericales. Proc. R. Soc. B. 284:20170066.
4 octobre, 2017 Centre, B.114 12h00 Julie Faure Chez les Gesneriaceae antillaises, la forme des fleurs est-elle adaptée à la forme des becs des espèces de colibris les pollinisant ?
11 octobre, 2017 Centre, B.114 12h00 Simon Joly Présentation d'un manuscrit: Accounting for intraspecific genetic correlations in ecological studies
18 octobre, 2017 Centre, B.114 12h00 Sébastien Renaut Wu, M. et al. 2017. Dissecting the basis of novel trait evolution in a radiation with widespread phylogenetic discordance. bioRxiv 201376.
25 octobre, 2017 Centre, B.114 12h00 à déterminer...
1 novembre, 2017 Centre, B.114 12h00 à déterminer...
8 novembre, 2017 Centre, B.114 12h00 Anne Bruneau Smith et al. In press. Disparity, diversity, and duplications in the Caryophyllales. New Phytologist.
15 novembre, 2017 Centre, B.114 12h00 Boris Domenech
22 novembre, 2017 Centre, B.114 12h00 Valérie Poulin
29 novembre, 2017 Centre, B.114 12h00 Luc Brouillet
6 décembre, 2017 Centre, B.114 12h00 Pratiques CSBQ
13 décembre, 2017 Centre, B.114 12h00 Colloque CSBQ -- --
20 décembre, 2017 Centre, B.114 12h00 Tammy Elliott

Été 2017

Date Lieu Heure Présentateur Article Doc
8 mai, 2017 Centre, B.114 15h00 Simon Joly Zhang Y.-Y., Parepa M., Fischer M., Bossdorf O. 2016. Epigenetics of Colonizing Species? A Study of Japanese Knotweed in Central Europe. In: Barrett et al., Editors. Invasion Genetics. John Wiley & Sons, Ltd. p. 328–340.
15 mai, 2017 Centre, B.114 15h00 Gonzalo Bilbao Steinbauer M.J. et al. 2016. Topography-driven isolation, speciation and a global increase of endemism with elevation. Global Ecol. Biogeogr. 25:1097–1107.
29 mai, 2017 -- -- -- pause
5 juin, 2017 Centre, B.114 15h00 Edeline Gagnon Simonsen A.K. et al. 2017. Symbiosis limits establishment of legumes outside their native range at a global scale. Nature Communications. 8:14790.
12 juin, 2017 Centre, B.114 15h00 Simon Ingram T., Mahler D.L. 2013. SURFACE: detecting convergent evolution from comparative data by fitting Ornstein-Uhlenbeck models with stepwise Akaike Information Criterion. Methods Ecol Evol. 4:416–425.
19 juin, 2017 Centre, B.114 15h00 Gonzalo Pratique de présentation pour le congrès Botany --

Hiver 2017

Date Lieu Heure Présentateur Article Doc
16 janv, 2017 IRBV, D.362 15h00 Simon Joly Nachev V. et al. 2017. Cognition-mediated evolution of low-quality floral nectars. Science. 355:75–78.
23 janv, 2017 IRBV, D.362 15h00 Tammy Elliott Linder H.P. 2005. Evolution of diversity: the Cape flora. Trends in Plant Science. 10:536–541.
30 janv, 2017 Centre, B.114 15h00 Anne Bruneau Marshall et al. 2016. Bioquality hotspots in the tropical African flora. Current Biology. 26:3214–3219.
13 fev, 2017 Centre, B.114 15h00 Étienne laliberté Teste F.P. et al. 2017. Plant-soil feedback and the maintenance of diversity in Mediterranean-climate shrublands. Science. 355:173–176.
20 fev, 2017 Centre, B.114 15h00 Sébastien Renaut Beissinger et al. 2016. Recent demography drives changes in linked selection across the maize genome. Nature Plants. 2:16084.
27 fev, 2017 Centre, B.114 15h00 à déterminer --
6 mars, 2017 Centre, B.114 15h00 Gonzalo Bilbao Abrahamczyk S. et al. 2017. Pollinator adaptation and the evolution of floral nectar sugar composition. J. Evol. Biol. 30:112–127.
13 mars, 2017 Centre, B.114 15h00 à déterminer --
20 mars, 2017 Centre, B.114 15h00 Jacynthe Masse Yeaman et al. 2016. Convergent local adaptation to climate in distantly related conifers. Science. 353:1431–1433.
27 mars, 2017 Centre, B.114 15h00 Sébastien Renaut Wright S.I. 2017. Evolution of genome size. eLS. John Wiley & Sons, Ltd.
10 avril, 2017 Centre, B.114 15h00 Simon Joly McDonald M.J., Rice D.P., Desai M.M. 2016. Sex speeds adaptation by altering the dynamics of molecular evolution. Nature. 531:233–236.
24 avril, 2017 Centre, B.114 15h00 Julie Faure Serrano-Serrano et al. 2017. Hummingbird pollination and the diversification of angiosperms: an old and successful association in Gesneriaceae. Proc R Soc London B. 284:20162816.

Automne 2016

Date Lieu Heure Présentateur Article Doc
12 sept, 2016 Centre, B.114 15h00 Sébastien Renaut Ziemann M. et al. 2016. Gene name errors are widespread in the scientific literature. Genome Biology. 17:177.
19 sept, 2016 Centre, B.114 15h00 Julie Faure Culbert B.M., Forrest J. 2016. Floral symmetry affects bumblebee approach consistency in artificial flowers. Journal of Pollination Ecology. 18.
26 sept, 2016 Centre, B.114 15h00 Simon Joly Spribille T. et al. 2016. Basidiomycete yeasts in the cortex of ascomycete macrolichens. Science. 353:488–492.
3 oct, 2016 Centre, B.114 15h00 Sébastien Renaut Streicher J.W. et al. 2016. How Should Genes and Taxa be Sampled for Phylogenomic Analyses with Missing Data? An Empirical Study in Iguanian Lizards. Syst Biol. 65:128–145.
17 oct, 2016 IRBV, D.362 15h00 Boris Domenech Kozak K.H., Wiens J.J. 2010. Accelerated rates of climatic-niche evolution underlie rapid species diversification. Ecology Letters. 13:1378–1389.
24 oct 2016 -- -- - Pas de réunion...
31 oct 2016 Centre, B.114 15h00 Étienne Laliberté Werner et al. 2014. A single evolutionary innovation drives the deep evolution of symbiotic N2-fixation in angiosperms. Nat Commun. 5:4087.
14 nov 2016 Centre, B.114 15h00 Sébastien Renaut Skibba R. 2016. The polling crisis: How to tell what people really think. Nature News. 538:304.
21 nov 2016 Centre, B.114 15h00 Anne Bruneau OMeara et al. 2016. Non-equilibrium dynamics and floral trait interactions shape extant angiosperm diversity. Proc. R. Soc. B. 283:20152304.
12 dec 2016 Centre, B.114 15h00 Alexis Carteron Phillips et al. 2013. The mycorrhizal-associated nutrient economy: a new framework for predicting carbon–nutrient couplings in temperate forests. New Phytologist. 199:41–51.

Été 2016

Date Lieu Heure Présentateur Article Doc
2 mai, 2016 Centre, B.114 15h00 Julie Faure Ollerton et al. 2009. A global test of the pollination syndrome hypothesis. Ann Bot. 103:1471–1480.
9 mai, 2016 Centre, B.114 15h00 Julie Faure Aigner. 2001. Optimality modeling and fitness trade-offs: when should plants become pollinator specialists? Oikos. 95:177–184.
Script R pour jouer avec le modèle d'Aigner avec intéractions: Aigner_negative_interactions.R
16 mai, 2016 Centre, B.114 12h00 Gonzalo Davis Rabosky et al. 2016. Coral snakes predict the evolution of mimicry across New World snakes. Nat Commun. 7:11484.
30 mai, 2016 IRBV, D.362 15h00 Boris Domenech Thomas et al. 2015. The historical origins of palaeotropical intercontinental disjunctions in the pantropical flowering plant family Annonaceae. Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics. 17:1–16.
6 juin, 2016 Centre, B.114 15h00 Sébastien Renaut Mills J.A. et al. 2015. Archiving primary data: solutions for long-term studies. Trends in Ecology & Evolution. 30:581–589.
4 juillet, 2016 Centre, B.114 15h00 Boris Domenech Voyage de récolte au Brésil
18 juillet, 2016 Centre, B.114 15h00 Simon Joly Lindholm et al. 2016. The ecology and evolutionary dynamics of meiotic drive. Trends in Ecology & Evolution. 31:315–326.

Hiver 2016

Date Lieu Heure Présentateur Article Doc
11 jan 2016 Centre, B.114 15h00 Sébastien Renaut Prum R.O. et al. 2015. A comprehensive phylogeny of birds (Aves) using targeted next-generation DNA sequencing. Nature. 526:569–573.
18 jan 2016 Centre, B.114 15h00 Simon Joly Schweizer R.M. et al. 2016. Genetic subdivision and candidate genes under selection in North American grey wolves. Mol Ecol. 25:380–402.
25 jan 2016 Centre, B.114 15h00 Luc Brouillet Spalink D. et al. 2016. Evolution of geographical place and niche space: Patterns of diversification in the North American sedge (Cyperaceae) flora. Mol Phylogenet and Evol. 95:183–195.
1 fev 2016 Centre, B.114 15h00 Gonzalo Bilbao Donoghue & Sanderson. 2015. Confluence, synnovation, and depauperons in plant diversification. New Phytol. 207:260–274.
8 fev 2016 Centre, B.114 15h00 Sébastien Renaut Ledford H. 2015. Crispr, the disruptor. Nature. 522:20-24.
15 fev 2016 Centre, B.114 15h00 Hermine Alexandre Hermine présentera ses résultats de simulations visant à déterminer l'impact de fluxuations environnementales sur l'évolution de stratégies généralistes
22 fev 2016 Centre, B.114 15h00 Simon Joly Discussion sur les pré-publications (preprints) et sur la révision post-publication (post publication peer review). Ce sont des sujets tendance sur les réseaux sociaux en ce moment entourant une conférence sur le sujet. Voir le site asapbio.org ou le mot click #ASAPbio pour plus d'informations.
29 fev 2016 -- -- -- Semaine de relâche
7 mar 2016 -- -- -- Soutenance de Tahiana -- Pas de rencontre
14 mar 2016 Centre, B.114 15h00 Boris Domenech Pennington & Lavin. 2016. The contrasting nature of woody plant species in different neotropical forest biomes reflects differences in ecological stability. New Phytol. 210:25–37.
21 mar 2016 Centre, B.114 15h00 -- Naciri Y. and Linder H.P. 2015. Species delimitation and relationships: The dance of the seven veils. Taxon. 64:3–16.
4 avril, 2016 Centre, B.114 15h00 Tahiana Strelin et al. 2016. Flower reshaping in the transition to hummingbird pollination in Loasaceae subfam. Loasoideae despite absence of corolla tubes or spurs. Evol Ecol.:1–17.
11 avril, 2016 Centre, B.114 15h00 Simon Joly Lagomarsino et al. 2016. The abiotic and biotic drivers of rapid diversification in Andean bellflowers (Campanulaceae). New Phytol.
18 avril, 2016 Centre, B.114 15h00 Tahiana Discussion sur QUASSE et un exemple d'application sur Angraecum.
25 avril, 2016 Centre, B.114 15h00 Simon Joly Présentation de résultats "compliqués" obtenus avec des modèle évolutifs.
Pour référence: Butler & King. 2004. Phylogenetic Comparative Analysis: A Modeling Approach for Adaptive Evolution. The American Naturalist. 164:683–695.

Automne 2015

Date Lieu Heure Présentateur Article
28 sept 2015 Centre, B.114 15h00 Sébastien Renaut Egan et al. 2015. Experimental evidence of genome-wide impact of ecological selection during early stages of speciation-with-gene-flow. Ecol Lett. 18:817–825.
4 Oct 2015 Centre, B.114 15h00 Simon Joly Beaulieu et al. 2015. Heterogeneous Rates of Molecular Evolution and Diversification Could Explain the Triassic Age Estimate for Angiosperms. Syst Biol. 64:869–878.
12 Oct 2015 -- -- -- Action de Grâce
19 Oct 2015 -- -- -- Semaine de relâche
26 Oct 2015 Centre, B.114 15h00 François Lambert Phuong et al. 2014. Delimiting species in the genus Otospermophilus (Rodentia: Sciuridae), using genetics, ecology, and morphology. Biol J Linn Soc, 113:1136-1151. pdf
2 Nov 2015 Centre, B.114 15h00 Julie Faure Forrest. 2015. Plant–pollinator interactions and phenological change: what can we learn about climate impacts from experiments and observations? Oikos. 124:4–13. pdf
9 Nov 2015 Centre, B.114 15h00 François Lambert Présentation de son projet de maîtrise.
16 Nov 2015 Centre, B.114 15h00 -- Discussion sur Publons. Consulter cet article dans Nature sur le sujet pour se mettre en appétit.
23 Nov 2015 Centre, B.114 15h00 Simon Joly Bordenstein and Theis. 2015. Host Biology in Light of the Microbiome: Ten Principles of Holobionts and Hologenomes. Plos Biol. 13(8):e1002226. pdf
30 Nov 2015 Centre, B.114 15h00 Sébastien Renaut Vines. 2015. The Core Inefficiency of Peer Review and a Potential Solution. Limnology and Oceanography Bulletin. 24:36-38. pdf
Axios Review
7 Dec 2015 Centre, B.114 15h00 Tahiana Andriananjamanantsoa Présentation de son article sur la biogéographie d'Angraecum
15 Dec 2015 Centre, B.114 15h00 Hermine Alexandre Boucher et al. 2014. Neutral biogeography and the evolution of climatic niches. The american naturalist. 183: 573--584